Наряду с крупными государственными университетами, отличающимися широким выбором специальностей, в Чехии существует множество частных вузов. Они имеют более тесные контакты с действующими фирмами, чем крупные государственные вузы, и делают ставку на междисциплинарное обучение и тесную связь теории с практикой. При этом многие из них завоевали высокий рейтинг и признание в области экономики, финансов, банковского дела. Поскольку их выпускники являются более подготовленными с практической точки зрения (обязательной частью обучения является полугодовая практика), они часто имеют лучшие шансы на трудоустройство, чем выпускники государственных вузов. 

Студенты в Чехии сами определяют, сколько часов в неделю они хотят заниматься. Чаще всего посещение лекций вообще необязательно, семинарские занятия требуют примерно 50% посещения. Считается, что учащиеся сами должны придерживаться дисциплины.

Примерно в середине семестра студенты составляют свой учебный план на следующий семестр – из обязательных предметов и предметов по выбору. На первых двух курсах магистерских программ обучения, а также на первом курсе бакалаврских программ, все предметы обязательны для изучения. На последующих курсах студент выбирает себе предметы из каталога предметов. Не стоит опасаться проблем с выбором: на первом курсе студент получает общие знания во всех областях своей специальности, что позволяет ему лучше определиться с выбором специализации в последующем.

• В государственных вузах обучение для иностранных студентов (на чешском языке) бесплатное. В будущем государство планирует ввести небольшую плату за обучение, в пределах 300 евро в год. 
• В частных вузах обучение платное, вместе с тем, его стоимость невысока: варьирует в пределах 1000-2500 евро за год обучения, с возможностью оплаты по семестрам. Знание чешского языка на начальном этапе не требуется.
• Обучение на иностранных языках (английском) – платное. В этом случае размер платы за год, в зависимости от престижа вуза, составляет от 3000 долларов (на экономическом факультете Чешского технического университета) до 10000 долларов (на медицинских факультетах Карлова университета). 

Поступить в государственные вузы сложнее, чем в частные, так как там существует более высокий конкурс, иногда достигающий десятков человек на место, в зависимости от специальности. Все иностранцы, помимо основных вступительных экзаменов, должны сдать экзамен по чешскому языку. При поступлении в частные вузы на начальном этапе глубокого знания языка не требуется, что позволяет сократить процесс подготовки к поступлению до 1 месяца.